Наукова робота кафедри передбачає планування та виконання дисертаційних робіт, виконання кафедральних і міжкафедральних науково-дослідних робіт, організацію та участь у проведенні всеукраїнських і міжнародних наукових форумів, підготовку студентських наукових робіт. Щорічно на засіданнях кафедри заслуховуються звіти дисертантів кафедр про виконану наукову роботу та звіти про виконання кафедральних та міжкафедральних науково-дослідних робіт. 

Напрямки наукових дослiджень кафедри iнфекцiйних хвороб: а) диференцiйне застосування сучасних ентеросорбентiв при кишкових iнфекцiях рiзної етiологiї, лептоспiрозi, вiрусних гепатитах, гострих респіраторних вірусних інфекціях - окремо i в поєднаннi з iмуномодуляторами; б) застосування противiрусних препаратiв, iндукторiв ендогенного iнтерферону та iмуномодуляторiв, окремо i в комбiнацiї, при вiрусних гепатитах та при VZV-iнфекцiї; в) оптимізація комплексного лiкування лептоспiрозу iз застосуванням донорського протилептоспiрозного iмуноглобулiну; г) роль дисфункції ендотелію в патогенезі вірусних гепатитів В і С; д) особливостi мiкробiоценозу кишок при ГКI; е) клінічні особливості патології шкіри на тлі вірусних гепатитів, деяких паразитозів;   є) удосконалення лікування хворих на алергічні і атопічні дерматози; ж) моно- і змішані інфекції, що передаються кліщами, вдосконалення діагностично-лікувальних технологій і заходів біобезпеки.